C# Класс CanvasClean.EnrichmentUtilities

Показать файл Открыть проект Примеры использования класса

Открытые свойства

Свойство Тип Описание
numberOfGCbins int

Открытые методы

Метод Описание
GetCountsByGC ( List bins, NexteraManifest manifest, List &countsByGC, List &counts ) : void

Assumes the bins are sorted by genomic coordinates

GetOnTargetBins ( IEnumerable bins, NexteraManifest manifest ) : IEnumerable

Get the on-target bins by intersecting the manifest.

Описание методов

GetCountsByGC() публичный статический Метод

Assumes the bins are sorted by genomic coordinates
public static GetCountsByGC ( List bins, NexteraManifest manifest, List &countsByGC, List &counts ) : void
bins List Bins whose counts are to be normalized
manifest NexteraManifest
countsByGC List An array of lists. Each array element (0-100) will hold a list of counts whose bins have the same GC content.
counts List Will hold all of the autosomal counts present in 'bins'
Результат void

GetOnTargetBins() публичный статический Метод

Get the on-target bins by intersecting the manifest.
public static GetOnTargetBins ( IEnumerable bins, NexteraManifest manifest ) : IEnumerable
bins IEnumerable
manifest NexteraManifest
Результат IEnumerable

Описание свойств

numberOfGCbins публичное статическое свойство

public static int numberOfGCbins
Результат int