C# 클래스 CanvasClean.EnrichmentUtilities

파일 보기 프로젝트 열기: Illumina/canvas 1 사용 예제들

공개 프로퍼티들

프로퍼티	타입	설명
numberOfGCbins	int

공개 메소드들

메소드	설명
GetCountsByGC ( List bins, NexteraManifest manifest, List &countsByGC, List &counts ) : void	Assumes the bins are sorted by genomic coordinates
GetOnTargetBins ( IEnumerable bins, NexteraManifest manifest ) : IEnumerable	Get the on-target bins by intersecting the manifest.

메소드 상세

GetCountsByGC() 공개 정적인 메소드

Assumes the bins are sorted by genomic coordinates

public static GetCountsByGC ( List bins, NexteraManifest manifest, List &countsByGC, List &counts ) : void
bins	List	Bins whose counts are to be normalized
manifest	NexteraManifest
countsByGC	List	An array of lists. Each array element (0-100) will hold a list of counts whose bins have the same GC content.
counts	List	Will hold all of the autosomal counts present in 'bins'
리턴	void

GetOnTargetBins() 공개 정적인 메소드

Get the on-target bins by intersecting the manifest.

public static GetOnTargetBins ( IEnumerable bins, NexteraManifest manifest ) : IEnumerable
bins	IEnumerable
manifest	NexteraManifest
리턴	IEnumerable

프로퍼티 상세

numberOfGCbins 공개적으로 정적으로 프로퍼티

public static int numberOfGCbins
리턴	int