C# Класс Coon.Compass.FdrOptimizer.InputFile

Показать файл Открыть проект

Открытые свойства

Свойство	Тип	Описание
FdrFilteredPSMs	List
FdrFilteredPeptides	List
PeptideSpectralMatches	List
Peptides	List

Открытые методы

Метод	Описание
GetMedianValue ( List values ) : double
InputFile ( string filePath ) : System
Read ( IList fixedModifications, int numberOfTopHits = 1, bool higherScoresAreBetter = false ) : void
ReducePsms ( IEqualityComparer comparer ) : void
UpdatePsmInformation ( MSDataFile dataFile, bool is2dFDR = true, bool useMedian = true, double evalueThreshold = 1e-3 ) : void

Описание методов

GetMedianValue() публичный статический Метод

public static GetMedianValue ( List values ) : double
values	List
Результат	double

InputFile() публичный Метод

public InputFile ( string filePath ) : System
filePath	string
Результат	System

Read() публичный Метод

public Read ( IList fixedModifications, int numberOfTopHits = 1, bool higherScoresAreBetter = false ) : void
fixedModifications	IList
numberOfTopHits	int
higherScoresAreBetter	bool
Результат	void

ReducePsms() публичный Метод

public ReducePsms ( IEqualityComparer comparer ) : void
comparer	IEqualityComparer
Результат	void

UpdatePsmInformation() публичный Метод

public UpdatePsmInformation ( MSDataFile dataFile, bool is2dFDR = true, bool useMedian = true, double evalueThreshold = 1e-3 ) : void
dataFile	MSDataFile
is2dFDR	bool
useMedian	bool
evalueThreshold	double
Результат	void

Описание свойств

FdrFilteredPSMs публичное свойство

public List FdrFilteredPSMs
Результат	List

FdrFilteredPeptides публичное свойство

public List FdrFilteredPeptides
Результат	List

PeptideSpectralMatches публичное свойство

public List PeptideSpectralMatches
Результат	List

Peptides публичное свойство

public List Peptides
Результат	List