C# Класс BatchFdrOptimizer.PeptideHit

Показать файл Открыть проект Примеры использования класса

Защищенные свойства (Protected)

Свойство	Тип	Описание
adjustedPrecursorMassError	double
decoy	bool
dynamicModifications	string
eValueScore	double
experimentalNeutralMass	double
isolationMZ	double
isolationMass	double
precursorMassError	double
qValue	double
sequence	string
theoreticalNeutralMass	double

Открытые методы

Метод	Описание
PeptideHit ( string sequence, string dynamicModifications, double eValueScore, bool decoy, Peptide peptide, IXRawfile2 raw, int scanNumber, int firstScanNumber, int charge ) : System
PeptideHit ( string sequence, string dynamicModifications, double eValueScore, bool decoy, double isolationMZ, double isolationMass, double theoreticalNeutralMass, double experimentalNeutralMass, double precursorMassError, double adjustedPrecursorMassError, double qValue ) : System

Защищенные методы

Метод	Описание
CalculatePrecursorMassError ( IXRawfile2 raw, int scanNumber, int firstScanNumber, int charge ) : void
MZFromMassAndCharge ( double mass, int charge ) : double
MassFromMZAndCharge ( double mz, int charge ) : double

Описание методов

CalculatePrecursorMassError() защищенный Метод

protected CalculatePrecursorMassError ( IXRawfile2 raw, int scanNumber, int firstScanNumber, int charge ) : void
raw	IXRawfile2
scanNumber	int
firstScanNumber	int
charge	int
Результат	void

MZFromMassAndCharge() защищенный статический Метод

protected static MZFromMassAndCharge ( double mass, int charge ) : double
mass	double
charge	int
Результат	double

MassFromMZAndCharge() защищенный статический Метод

protected static MassFromMZAndCharge ( double mz, int charge ) : double
mz	double
charge	int
Результат	double

PeptideHit() публичный Метод

public PeptideHit ( string sequence, string dynamicModifications, double eValueScore, bool decoy, Peptide peptide, IXRawfile2 raw, int scanNumber, int firstScanNumber, int charge ) : System
sequence	string
dynamicModifications	string
eValueScore	double
decoy	bool
peptide	Peptide
raw	IXRawfile2
scanNumber	int
firstScanNumber	int
charge	int
Результат	System

PeptideHit() публичный Метод

public PeptideHit ( string sequence, string dynamicModifications, double eValueScore, bool decoy, double isolationMZ, double isolationMass, double theoreticalNeutralMass, double experimentalNeutralMass, double precursorMassError, double adjustedPrecursorMassError, double qValue ) : System
sequence	string
dynamicModifications	string
eValueScore	double
decoy	bool
isolationMZ	double
isolationMass	double
theoreticalNeutralMass	double
experimentalNeutralMass	double
precursorMassError	double
adjustedPrecursorMassError	double
qValue	double
Результат	System

Описание свойств

adjustedPrecursorMassError защищенное свойство

protected double adjustedPrecursorMassError
Результат	double

decoy защищенное свойство

protected bool decoy
Результат	bool

dynamicModifications защищенное свойство

protected string dynamicModifications
Результат	string

eValueScore защищенное свойство

protected double eValueScore
Результат	double

experimentalNeutralMass защищенное свойство

protected double experimentalNeutralMass
Результат	double

isolationMZ защищенное свойство

protected double isolationMZ
Результат	double

isolationMass защищенное свойство

protected double isolationMass
Результат	double

precursorMassError защищенное свойство

protected double precursorMassError
Результат	double

qValue защищенное свойство

protected double qValue
Результат	double

sequence защищенное свойство

protected string sequence
Результат	string

theoreticalNeutralMass защищенное свойство

protected double theoreticalNeutralMass
Результат	double