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C# 클래스 Coon.Compass.TagQuant.TagQuant

파일 보기 프로젝트 열기: dbaileychess/Compass 1 사용 예제들

공개 프로퍼티들

프로퍼티	타입	설명
CalculatePurity	bool
DontQuantifyETD	bool
ETDQuantPosition	int
FtMassTolerance	CSMSL.Tolerance
InputFiles	List
ItMassTolerance	CSMSL.Tolerance
MS3Quant	bool
NoisebandCap	bool
OutputDirectory	string
PurityMatrices	IsobaricTagPurityCorrection>.Dictionary
PurityWindowInTh	double
RawFileDirectory	string
RawFiles	ThermoRawFile>.Dictionary
UsedTags	TagInformation>.SortedList

공개 메소드들

메소드	설명
Run ( ) : void
TagQuant ( string outputDirectory, string rawFileDirectory, IEnumerable inputFiles, IEnumerable tags, Tolerance itTolerance, Tolerance ftTolerance, bool isMS3Quant = false, int etdQuantPosition, bool nosiebasecap = false, bool isETDQuantified = true, bool calculatePurity = false ) : System

보호된 메소드들

메소드	설명
OnUpdateLog ( string message ) : void

비공개 메소드들

메소드	설명
BuildPurityMatrixes ( IEnumerable inputTags ) : void
DeterminePurity ( MSDataScan scan, double mz, int charge, DoubleRange isolationRange ) : double
LoadFiles ( IEnumerable filePaths, bool ms3Quant = false ) : IEnumerable
Log ( string msg ) : void
Normalize ( IEnumerable quantFiles ) : void
OnProgressUpdate ( int percent ) : void
PurityCorrect ( IEnumerable peaks, bool isDecoy ) : void
WriteLog ( ) : void
WriteOutputFiles ( IEnumerable quantFiles ) : void

메소드 상세

프로퍼티 상세