C# 클래스 Coon.Compass.DatabaseMaker.DatabaseMaker

파일 보기 프로젝트 열기: dbaileychess/Compass 1 사용 예제들

공개 프로퍼티들

프로퍼티 타입 설명
LOG_FILENAME string
MAKEBLASTDB_FILENAME string

공개 메소드들

메소드 설명
CreateDatabase ( ) : void
DatabaseMaker ( DatabaseMakerOptions options ) : System
DisplayVerboseOptions ( bool verboseOptions, DatabaseMakerOptions Options ) : void
MakeBlastDatabase ( string outputfolder, string infile, string outfile ) : void
WriteFasta ( string fasta_file, FastaWriter Writer ) : void

비공개 메소드들

메소드 설명
GenerateLog ( string outputDirectory, string logFileName = "DatabaseMaker.log" ) : void

Generates a log file detailing the parameters used
InvalidHeader ( Fasta fasta ) : void

메소드 상세

CreateDatabase() 공개 메소드

public CreateDatabase ( ) : void
리턴 void

DatabaseMaker() 공개 메소드

public DatabaseMaker ( DatabaseMakerOptions options ) : System
options DatabaseMakerOptions
리턴 System

DisplayVerboseOptions() 공개 메소드

public DisplayVerboseOptions ( bool verboseOptions, DatabaseMakerOptions Options ) : void
verboseOptions bool
Options DatabaseMakerOptions
리턴 void

MakeBlastDatabase() 공개 정적인 메소드

public static MakeBlastDatabase ( string outputfolder, string infile, string outfile ) : void
outputfolder string
infile string
outfile string
리턴 void

WriteFasta() 공개 메소드

public WriteFasta ( string fasta_file, FastaWriter Writer ) : void
fasta_file string
Writer CSMSL.IO.FastaWriter
리턴 void

프로퍼티 상세

LOG_FILENAME 공개적으로 정적으로 프로퍼티

public static string LOG_FILENAME
리턴 string

MAKEBLASTDB_FILENAME 공개적으로 정적으로 프로퍼티

public static string MAKEBLASTDB_FILENAME
리턴 string