C# Класс Coon.Compass.Lotor.PSM

Показать файл Открыть проект Примеры использования класса

Открытые свойства

Свойство	Тип	Описание
BasePeptide	Peptide
BestSiteDeterminingFragments	].int[
Charge	int
Filename	string
LocalizationResult	].double[
NumSiteDeterminingFragments	].int[
PeptideIsoforms	HashSet
ScanNumber	int
SecondBestSiteDeterminingFragments	].int[
StartResidue	int
VariabledModifications	List

Открытые методы

Метод	Описание
Calc ( double pvalue ) : ].double[
GenerateIsoforms ( bool ignoreCTerminalMods = false ) : int
MatchIsofroms ( FragmentTypes type, Tolerance tolerance, double cutoffThreshold, bool phopshoNeutralLoss ) : void
PSM ( int scannumber, string rawfileName ) : System
SetRawFile ( MSDataFile dataFile ) : void

Приватные методы

Метод	Описание
GetSiteDeterminingFragments ( PeptideIsoform pep1, PeptideIsoform pep2 ) : IEnumerable

Описание методов

Calc() публичный Метод

public Calc ( double pvalue ) : ].double[
pvalue	double
Результат	].double[

GenerateIsoforms() публичный Метод

public GenerateIsoforms ( bool ignoreCTerminalMods = false ) : int
ignoreCTerminalMods	bool
Результат	int

MatchIsofroms() публичный Метод

public MatchIsofroms ( FragmentTypes type, Tolerance tolerance, double cutoffThreshold, bool phopshoNeutralLoss ) : void
type	FragmentTypes
tolerance	CSMSL.Tolerance
cutoffThreshold	double
phopshoNeutralLoss	bool
Результат	void

PSM() публичный Метод

public PSM ( int scannumber, string rawfileName ) : System
scannumber	int
rawfileName	string
Результат	System

SetRawFile() публичный Метод

public SetRawFile ( MSDataFile dataFile ) : void
dataFile	MSDataFile
Результат	void

Описание свойств

BasePeptide публичное свойство

public Peptide BasePeptide
Результат	Peptide

BestSiteDeterminingFragments публичное свойство

public int[,] BestSiteDeterminingFragments
Результат	].int[

Charge публичное свойство

public int Charge
Результат	int

Filename публичное свойство

public string Filename
Результат	string

LocalizationResult публичное свойство

public double[,] LocalizationResult
Результат	].double[

NumSiteDeterminingFragments публичное свойство

public int[,] NumSiteDeterminingFragments
Результат	].int[

PeptideIsoforms публичное свойство

public HashSet PeptideIsoforms
Результат	HashSet

ScanNumber публичное свойство

public int ScanNumber
Результат	int

SecondBestSiteDeterminingFragments публичное свойство

public int[,] SecondBestSiteDeterminingFragments
Результат	].int[

StartResidue публичное свойство

public int StartResidue
Результат	int

VariabledModifications публичное свойство

public List VariabledModifications
Результат	List