C# 클래스 Coon.Compass.Lotor.PSM

파일 보기 프로젝트 열기: dbaileychess/Compass 1 사용 예제들

공개 프로퍼티들

프로퍼티	타입	설명
BasePeptide	Peptide
BestSiteDeterminingFragments	].int[
Charge	int
Filename	string
LocalizationResult	].double[
NumSiteDeterminingFragments	].int[
PeptideIsoforms	HashSet
ScanNumber	int
SecondBestSiteDeterminingFragments	].int[
StartResidue	int
VariabledModifications	List

공개 메소드들

메소드	설명
Calc ( double pvalue ) : ].double[
GenerateIsoforms ( bool ignoreCTerminalMods = false ) : int
MatchIsofroms ( FragmentTypes type, Tolerance tolerance, double cutoffThreshold, bool phopshoNeutralLoss ) : void
PSM ( int scannumber, string rawfileName ) : System
SetRawFile ( MSDataFile dataFile ) : void

비공개 메소드들

메소드	설명
GetSiteDeterminingFragments ( PeptideIsoform pep1, PeptideIsoform pep2 ) : IEnumerable

메소드 상세

Calc() 공개 메소드

public Calc ( double pvalue ) : ].double[
pvalue	double
리턴	].double[

GenerateIsoforms() 공개 메소드

public GenerateIsoforms ( bool ignoreCTerminalMods = false ) : int
ignoreCTerminalMods	bool
리턴	int

MatchIsofroms() 공개 메소드

public MatchIsofroms ( FragmentTypes type, Tolerance tolerance, double cutoffThreshold, bool phopshoNeutralLoss ) : void
type	FragmentTypes
tolerance	CSMSL.Tolerance
cutoffThreshold	double
phopshoNeutralLoss	bool
리턴	void

PSM() 공개 메소드

public PSM ( int scannumber, string rawfileName ) : System
scannumber	int
rawfileName	string
리턴	System

SetRawFile() 공개 메소드

public SetRawFile ( MSDataFile dataFile ) : void
dataFile	MSDataFile
리턴	void

프로퍼티 상세

BasePeptide 공개적으로 프로퍼티

public Peptide BasePeptide
리턴	Peptide

BestSiteDeterminingFragments 공개적으로 프로퍼티

public int[,] BestSiteDeterminingFragments
리턴	].int[

Charge 공개적으로 프로퍼티

public int Charge
리턴	int

Filename 공개적으로 프로퍼티

public string Filename
리턴	string

LocalizationResult 공개적으로 프로퍼티

public double[,] LocalizationResult
리턴	].double[

NumSiteDeterminingFragments 공개적으로 프로퍼티

public int[,] NumSiteDeterminingFragments
리턴	].int[

PeptideIsoforms 공개적으로 프로퍼티

public HashSet PeptideIsoforms
리턴	HashSet

ScanNumber 공개적으로 프로퍼티

public int ScanNumber
리턴	int

SecondBestSiteDeterminingFragments 공개적으로 프로퍼티

public int[,] SecondBestSiteDeterminingFragments
리턴	].int[

StartResidue 공개적으로 프로퍼티

public int StartResidue
리턴	int

VariabledModifications 공개적으로 프로퍼티

public List VariabledModifications
리턴	List