C# Класс CSMSL.Proteomics.Protease

Наследование: IProtease

Показать файл Открыть проект Примеры использования класса

Открытые свойства

Свойство	Тип	Описание
UserProteasePath	string

Открытые методы

Метод	Описание
AddProtease ( string name, Terminus terminus, string cut, string noCut = "" ) : Protease
GetAllProteases ( ) : IEnumerable
GetDigestionSites ( IAminoAcidSequence aminoacidpolymer ) : IEnumerable
GetDigestionSites ( string sequence ) : IEnumerable
GetProtease ( string name ) : Protease
Load ( ) : void	Load the default modification file If the default modification is missing or corrupted, it will auto generate it
Load ( string filePath ) : void	Load a protease file
MissedCleavages ( IAminoAcidSequence aminoAcidSequence ) : int
MissedCleavages ( string sequence ) : int
Protease ( string name, Terminus terminus, string cut, string nocut = "", string cleavePattern = "" ) : System
RemoveProtease ( Protease protease ) : bool
RemoveProtease ( string name ) : bool
RestoreDefaults ( ) : void
Save ( ) : void
SaveTo ( string filePath ) : void
ToString ( ) : string
TryGetProtease ( string name, Protease &protease ) : bool
this ( string name ) : Protease

Приватные методы

Метод	Описание
OnProteasesChanged ( ) : void
Protease ( ) : System

Описание методов

AddProtease() публичный статический Метод

public static AddProtease ( string name, Terminus terminus, string cut, string noCut = "" ) : Protease
name	string
terminus	Terminus
cut	string
noCut	string
Результат	Protease

GetAllProteases() публичный статический Метод

public static GetAllProteases ( ) : IEnumerable
Результат	IEnumerable

GetDigestionSites() публичный Метод

public GetDigestionSites ( IAminoAcidSequence aminoacidpolymer ) : IEnumerable
aminoacidpolymer	IAminoAcidSequence
Результат	IEnumerable

GetDigestionSites() публичный Метод

public GetDigestionSites ( string sequence ) : IEnumerable
sequence	string
Результат	IEnumerable

GetProtease() публичный статический Метод

public static GetProtease ( string name ) : Protease
name	string
Результат	Protease

Load() публичный статический Метод

Load the default modification file If the default modification is missing or corrupted, it will auto generate it

public static Load ( ) : void
Результат	void

Load() публичный статический Метод

Load a protease file

public static Load ( string filePath ) : void
filePath	string	The path to the protase file
Результат	void

MissedCleavages() публичный Метод

public MissedCleavages ( IAminoAcidSequence aminoAcidSequence ) : int
aminoAcidSequence	IAminoAcidSequence
Результат	int

MissedCleavages() публичный Метод

public MissedCleavages ( string sequence ) : int
sequence	string
Результат	int

Protease() публичный Метод

public Protease ( string name, Terminus terminus, string cut, string nocut = "", string cleavePattern = "" ) : System
name	string
terminus	Terminus
cut	string
nocut	string
cleavePattern	string
Результат	System

RemoveProtease() публичный статический Метод

public static RemoveProtease ( Protease protease ) : bool
protease	Protease
Результат	bool

RemoveProtease() публичный статический Метод

public static RemoveProtease ( string name ) : bool
name	string
Результат	bool

RestoreDefaults() публичный статический Метод

public static RestoreDefaults ( ) : void
Результат	void

Save() публичный статический Метод

public static Save ( ) : void
Результат	void

SaveTo() публичный статический Метод

public static SaveTo ( string filePath ) : void
filePath	string
Результат	void

ToString() публичный Метод

public ToString ( ) : string
Результат	string

TryGetProtease() публичный статический Метод

public static TryGetProtease ( string name, Protease &protease ) : bool
name	string
protease	Protease
Результат	bool

this() публичный Метод

public this ( string name ) : Protease
name	string
Результат	Protease

Описание свойств

UserProteasePath публичное статическое свойство

public static string UserProteasePath
Результат	string