C# Класс CSMSL.Analysis.Identification.MSSearchEngine

Показать файл Открыть проект

Защищенные свойства (Protected)

Свойство	Тип	Описание
Peptides	List

Открытые методы

Метод	Описание
AddVariableModification ( IMass modificaiton, IAminoAcid aminoAcid ) : void
AddVariableModification ( IMass modificaiton, ModificationSites sites ) : void
AddVariableModification ( IMass modificaiton, Terminus terminus ) : void
AddVariableModification ( IMass modification, char residue ) : void
ClearVariableModifications ( ) : void
LoadPeptides ( IEnumerable peptides ) : void
Search ( IMassSpectrum massSpectrum, Peptide peptide ) : PeptideSpectralMatch
Search ( IMassSpectrum massSpectrum, Peptide peptide, FragmentTypes fragmentTypes, Tolerance productMassTolerance ) : PeptideSpectralMatch
Search ( IMassSpectrum massSpectrum, IEnumerable peptides ) : SortedMaxSizedContainer
Search ( IMassSpectrum massSpectrum, IEnumerable peptides, FragmentTypes fragmentTypes, Tolerance productMassTolerance ) : SortedMaxSizedContainer

Защищенные методы

Метод	Описание
MSSearchEngine ( ) : System.Collections.Generic

Описание методов

AddVariableModification() публичный Метод

public AddVariableModification ( IMass modificaiton, IAminoAcid aminoAcid ) : void
modificaiton	IMass
aminoAcid	IAminoAcid
Результат	void

AddVariableModification() публичный Метод

public AddVariableModification ( IMass modificaiton, ModificationSites sites ) : void
modificaiton	IMass
sites	ModificationSites
Результат	void

AddVariableModification() публичный Метод

public AddVariableModification ( IMass modificaiton, Terminus terminus ) : void
modificaiton	IMass
terminus	Terminus
Результат	void

AddVariableModification() публичный Метод

public AddVariableModification ( IMass modification, char residue ) : void
modification	IMass
residue	char
Результат	void

ClearVariableModifications() публичный Метод

public ClearVariableModifications ( ) : void
Результат	void

LoadPeptides() публичный Метод

public LoadPeptides ( IEnumerable peptides ) : void
peptides	IEnumerable
Результат	void

MSSearchEngine() защищенный Метод

protected MSSearchEngine ( ) : System.Collections.Generic
Результат	System.Collections.Generic

Search() публичный Метод

public Search ( IMassSpectrum massSpectrum, Peptide peptide ) : PeptideSpectralMatch
massSpectrum	IMassSpectrum
peptide	Peptide
Результат	PeptideSpectralMatch

Search() публичный абстрактный Метод

public abstract Search ( IMassSpectrum massSpectrum, Peptide peptide, FragmentTypes fragmentTypes, Tolerance productMassTolerance ) : PeptideSpectralMatch
massSpectrum	IMassSpectrum
peptide	Peptide
fragmentTypes	FragmentTypes
productMassTolerance	Tolerance
Результат	PeptideSpectralMatch

Search() публичный Метод

public Search ( IMassSpectrum massSpectrum, IEnumerable peptides ) : SortedMaxSizedContainer
massSpectrum	IMassSpectrum
peptides	IEnumerable
Результат	SortedMaxSizedContainer

Search() публичный Метод

public Search ( IMassSpectrum massSpectrum, IEnumerable peptides, FragmentTypes fragmentTypes, Tolerance productMassTolerance ) : SortedMaxSizedContainer
massSpectrum	IMassSpectrum
peptides	IEnumerable
fragmentTypes	FragmentTypes
productMassTolerance	Tolerance
Результат	SortedMaxSizedContainer

Описание свойств

Peptides защищенное свойство

protected List Peptides
Результат	List