C# Class CSMSL.Analysis.Identification.MSSearchEngine

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Protected Properties

Свойство	Type	Description
Peptides	List

Méthodes publiques

Méthode	Description
AddVariableModification ( IMass modificaiton, IAminoAcid aminoAcid ) : void
AddVariableModification ( IMass modificaiton, ModificationSites sites ) : void
AddVariableModification ( IMass modificaiton, Terminus terminus ) : void
AddVariableModification ( IMass modification, char residue ) : void
ClearVariableModifications ( ) : void
LoadPeptides ( IEnumerable peptides ) : void
Search ( IMassSpectrum massSpectrum, Peptide peptide ) : PeptideSpectralMatch
Search ( IMassSpectrum massSpectrum, Peptide peptide, FragmentTypes fragmentTypes, Tolerance productMassTolerance ) : PeptideSpectralMatch
Search ( IMassSpectrum massSpectrum, IEnumerable peptides ) : SortedMaxSizedContainer
Search ( IMassSpectrum massSpectrum, IEnumerable peptides, FragmentTypes fragmentTypes, Tolerance productMassTolerance ) : SortedMaxSizedContainer

Méthodes protégées

Méthode	Description
MSSearchEngine ( ) : System.Collections.Generic

Method Details

AddVariableModification() public méthode

public AddVariableModification ( IMass modificaiton, IAminoAcid aminoAcid ) : void
modificaiton	IMass
aminoAcid	IAminoAcid
Résultat	void

AddVariableModification() public méthode

public AddVariableModification ( IMass modificaiton, ModificationSites sites ) : void
modificaiton	IMass
sites	ModificationSites
Résultat	void

AddVariableModification() public méthode

public AddVariableModification ( IMass modificaiton, Terminus terminus ) : void
modificaiton	IMass
terminus	Terminus
Résultat	void

AddVariableModification() public méthode

public AddVariableModification ( IMass modification, char residue ) : void
modification	IMass
residue	char
Résultat	void

ClearVariableModifications() public méthode

public ClearVariableModifications ( ) : void
Résultat	void

LoadPeptides() public méthode

public LoadPeptides ( IEnumerable peptides ) : void
peptides	IEnumerable
Résultat	void

MSSearchEngine() protected méthode

protected MSSearchEngine ( ) : System.Collections.Generic
Résultat	System.Collections.Generic

Search() public méthode

public Search ( IMassSpectrum massSpectrum, Peptide peptide ) : PeptideSpectralMatch
massSpectrum	IMassSpectrum
peptide	Peptide
Résultat	PeptideSpectralMatch

Search() public abstract méthode

public abstract Search ( IMassSpectrum massSpectrum, Peptide peptide, FragmentTypes fragmentTypes, Tolerance productMassTolerance ) : PeptideSpectralMatch
massSpectrum	IMassSpectrum
peptide	Peptide
fragmentTypes	FragmentTypes
productMassTolerance	Tolerance
Résultat	PeptideSpectralMatch

Search() public méthode

public Search ( IMassSpectrum massSpectrum, IEnumerable peptides ) : SortedMaxSizedContainer
massSpectrum	IMassSpectrum
peptides	IEnumerable
Résultat	SortedMaxSizedContainer

Search() public méthode

public Search ( IMassSpectrum massSpectrum, IEnumerable peptides, FragmentTypes fragmentTypes, Tolerance productMassTolerance ) : SortedMaxSizedContainer
massSpectrum	IMassSpectrum
peptides	IEnumerable
fragmentTypes	FragmentTypes
productMassTolerance	Tolerance
Résultat	SortedMaxSizedContainer

Property Details

Peptides protected_oe property

protected List Peptides
Résultat	List