C# 클래스 Coon.Compass.Lotor.Lotor

파일 보기 프로젝트 열기: dbaileychess/Compass 1 사용 예제들

공개 프로퍼티들

프로퍼티	타입	설명
FixedModifications	List
QuantifiedModifications	List

공개 메소드들

메소드	설명
GetPValue ( PSM psm, Tolerance prod_tolerance, double cutoff ) : double
Localize ( ) : void
LocalizedIsoform ( double data ) : Tuple
Log ( string message, bool isError = false ) : void
Lotor ( string rawFileDirectory, string inputcsvFile, string outputDirectory, List fixedModifications, List quantifiedModifications, Tolerance prod_Tolerance, int scoreCutoff, bool separateGroups, double productThreshold, bool ignoreCTerminal, bool reduceSites, FragmentTypes fragType, bool phosphoNeutralLoss = false ) : System
ProgressUpdate ( double percent ) : void

보호된 메소드들

메소드	설명
OnFinished ( ) : void

비공개 메소드들

메소드	설명
CalculateBestIsoforms ( List psms, FragmentTypes fragType, Tolerance prod_tolerance, double productThreshold, bool phosphoNeutralLosses ) : List
CompileResults ( List hits, string csvFile, string outputDirectory, bool breakProteinsApart = false ) : List
LoadAllPSMs ( string csvFile, string rawFileDirectory, List fixedMods ) : List
LocalizedIsoformSimple ( PSM psm ) : Tuple
WriteResults ( List proteins, string csvFile, string outDirectory, int firstQuant, int lastQuant ) : void

메소드 상세

GetPValue() 공개 정적인 메소드

public static GetPValue ( PSM psm, Tolerance prod_tolerance, double cutoff ) : double
psm	PSM
prod_tolerance	CSMSL.Tolerance
cutoff	double
리턴	double

Localize() 공개 메소드

public Localize ( ) : void
리턴	void

LocalizedIsoform() 공개 정적인 메소드

public static LocalizedIsoform ( double data ) : Tuple
data	double
리턴	Tuple

Log() 공개 메소드

public Log ( string message, bool isError = false ) : void
message	string
isError	bool
리턴	void

Lotor() 공개 메소드

public Lotor ( string rawFileDirectory, string inputcsvFile, string outputDirectory, List fixedModifications, List quantifiedModifications, Tolerance prod_Tolerance, int scoreCutoff, bool separateGroups, double productThreshold, bool ignoreCTerminal, bool reduceSites, FragmentTypes fragType, bool phosphoNeutralLoss = false ) : System
rawFileDirectory	string
inputcsvFile	string
outputDirectory	string
fixedModifications	List
quantifiedModifications	List
prod_Tolerance	CSMSL.Tolerance
scoreCutoff	int
separateGroups	bool
productThreshold	double
ignoreCTerminal	bool
reduceSites	bool
fragType	FragmentTypes
phosphoNeutralLoss	bool
리턴	System

OnFinished() 보호된 메소드

protected OnFinished ( ) : void
리턴	void

ProgressUpdate() 공개 메소드

public ProgressUpdate ( double percent ) : void
percent	double
리턴	void

프로퍼티 상세

FixedModifications 공개적으로 정적으로 프로퍼티

public static List FixedModifications
리턴	List

QuantifiedModifications 공개적으로 정적으로 프로퍼티

public static List QuantifiedModifications
리턴	List