C# 클래스 CSMSL.IO.PsmReader

상속: IDisposable

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보호된 프로퍼티들

프로퍼티	타입	설명
_dataFiles	MSDataFile>.Dictionary
_disposed	bool
_extraColumns	List
_fixedMods	List
_proteins	Protein>.Dictionary
_variableMods	IMass>.Dictionary

공개 메소드들

메소드	설명
AddFixedModification ( Modification modification ) : IMass
AddFixedModifications ( IEnumerable modifications ) : void
AddMSDataFile ( MSDataFile dataFile ) : void
AddMSDataFiles ( IEnumerable dataFiles ) : void
AddVariableModification ( IMass modification, string name ) : void
AddVariableModification ( string chemicalFormula, string name ) : void
Dispose ( ) : void
LoadProteins ( IEnumerable proteins ) : void
LoadProteins ( string fastaFile ) : void
ReadExtra ( string p ) : void
ReadNextPsm ( ) : IEnumerable

보호된 메소드들

메소드	설명
Dispose ( bool disposing ) : void
PsmReader ( string filePath ) : System
SetFixedMods ( AminoAcidPolymer peptide ) : void
SetVariableMods ( AminoAcidPolymer peptide, string modname, int residue ) : void

메소드 상세

AddFixedModification() 공개 메소드

public AddFixedModification ( Modification modification ) : IMass
modification	Modification
리턴	IMass

AddFixedModifications() 공개 메소드

public AddFixedModifications ( IEnumerable modifications ) : void
modifications	IEnumerable
리턴	void

AddMSDataFile() 공개 메소드

public AddMSDataFile ( MSDataFile dataFile ) : void
dataFile	MSDataFile
리턴	void

AddMSDataFiles() 공개 메소드

public AddMSDataFiles ( IEnumerable dataFiles ) : void
dataFiles	IEnumerable
리턴	void

AddVariableModification() 공개 메소드

public AddVariableModification ( IMass modification, string name ) : void
modification	IMass
name	string
리턴	void

AddVariableModification() 공개 메소드

public AddVariableModification ( string chemicalFormula, string name ) : void
chemicalFormula	string
name	string
리턴	void

Dispose() 공개 메소드

public Dispose ( ) : void
리턴	void

Dispose() 보호된 메소드

protected Dispose ( bool disposing ) : void
disposing	bool
리턴	void

LoadProteins() 공개 메소드

public LoadProteins ( IEnumerable proteins ) : void
proteins	IEnumerable
리턴	void

LoadProteins() 공개 메소드

public LoadProteins ( string fastaFile ) : void
fastaFile	string
리턴	void

PsmReader() 보호된 메소드

protected PsmReader ( string filePath ) : System
filePath	string
리턴	System

ReadExtra() 공개 메소드

public ReadExtra ( string p ) : void
p	string
리턴	void

ReadNextPsm() 공개 추상적인 메소드

public abstract ReadNextPsm ( ) : IEnumerable
리턴	IEnumerable

SetFixedMods() 보호된 메소드

protected SetFixedMods ( AminoAcidPolymer peptide ) : void
peptide	AminoAcidPolymer
리턴	void

SetVariableMods() 보호된 메소드

protected SetVariableMods ( AminoAcidPolymer peptide, string modname, int residue ) : void
peptide	AminoAcidPolymer
modname	string
residue	int
리턴	void

프로퍼티 상세

_dataFiles 보호되어 있는 프로퍼티

protected Dictionary> _dataFiles
리턴	MSDataFile>.Dictionary

_disposed 보호되어 있는 프로퍼티

protected bool _disposed
리턴	bool

_extraColumns 보호되어 있는 프로퍼티

protected List _extraColumns
리턴	List

_fixedMods 보호되어 있는 프로퍼티

protected List _fixedMods
리턴	List

_proteins 보호되어 있는 프로퍼티

protected Dictionary _proteins
리턴	Protein>.Dictionary

_variableMods 보호되어 있는 프로퍼티

protected Dictionary _variableMods
리턴	IMass>.Dictionary