C# Class Morpheus.AminoAcidPolymer

Afficher le fichier Open project: cwenger/Morpheus Class Usage Examples

Méthodes publiques

Méthode Description
CalculateProductMass ( ProductType productType, int productNumber ) : double
CalculateProductMasses ( IEnumerable productTypes ) : List
SetFixedModifications ( IEnumerable fixedModifications ) : void
SetProductMassType ( MassType productMassType ) : void
ToString ( ) : string
this ( int index ) : char

Méthodes protégées

Méthode Description
AminoAcidPolymer ( string baseSequence ) : System
AminoAcidPolymer ( string baseSequence, Dictionary knownModifications ) : System
GetVariableModificationPatterns ( Dictionary possibleVariableModifications ) : Modification>>.IEnumerable

Private Methods

Méthode Description
GetVariableModificationPattern ( int variableModificationArray, IEnumerable possibleVariableModifications ) : Modification>.Dictionary
GetVariableModificationPatterns ( List possibleVariableModifications, int unmodifiedResiduesDesired, int variableModificationPattern, int index ) : IEnumerable
InitializeProductArrays ( ) : void

Method Details

AminoAcidPolymer() protected méthode

protected AminoAcidPolymer ( string baseSequence ) : System
baseSequence string
Résultat System

AminoAcidPolymer() protected méthode

protected AminoAcidPolymer ( string baseSequence, Dictionary knownModifications ) : System
baseSequence string
knownModifications Dictionary
Résultat System

CalculateProductMass() public méthode

public CalculateProductMass ( ProductType productType, int productNumber ) : double
productType ProductType
productNumber int
Résultat double

CalculateProductMasses() public méthode

public CalculateProductMasses ( IEnumerable productTypes ) : List
productTypes IEnumerable
Résultat List

GetVariableModificationPatterns() protected méthode

protected GetVariableModificationPatterns ( Dictionary possibleVariableModifications ) : Modification>>.IEnumerable
possibleVariableModifications Dictionary
Résultat Modification>>.IEnumerable

SetFixedModifications() public méthode

public SetFixedModifications ( IEnumerable fixedModifications ) : void
fixedModifications IEnumerable
Résultat void

SetProductMassType() public static méthode

public static SetProductMassType ( MassType productMassType ) : void
productMassType MassType
Résultat void

ToString() public méthode

public ToString ( ) : string
Résultat string

this() public méthode

public this ( int index ) : char
index int
Résultat char