C# Class PromoterReaction, Hero.Coli

Inheritance: IReaction

Afficher le fichier Open project: CyberCRI/Hero.Coli Class Usage Examples

Protected Properties

Свойство	Type	Description
_beta	float

Méthodes publiques

Méthode	Description
PromoterReaction ( ) : System.Collections.Generic
PromoterReaction ( PromoterReaction, r ) : System.Collections.Generic
ToString ( ) : string
buildPromoterFromProps ( PromoterProperties, props ) : IReaction,
getBeta ( ) : float
getFormula ( ) : TreeNode
getTerminatorFactor ( ) : float
hasValidData ( ) : bool
hillFunc ( float K, float concentration, double n ) : float
react ( ArrayList molecules ) : void
setBeta ( float beta ) : void
setFormula ( TreeNode tree ) : void
setTerminatorFactor ( float v ) : void
stepFunc ( float K, float concentration ) : float
tryInstantiateFromXml ( XmlNode node ) : bool

Méthodes protégées

Méthode	Description
PartialEquals ( IReaction, reaction ) : bool

Private Methods

Méthode	Description
execBool ( TreeNode node ) : float
execConstant ( TreeNode node, ArrayList molecules ) : float
execNode ( TreeNode node, ArrayList molecules ) : float
execNum ( TreeNode node, ArrayList molecules ) : float
execWord ( TreeNode node, ArrayList molecules ) : Molecule,
formulaEquals ( TreeNode formula1, TreeNode formula2 ) : bool
loadEnergyCost ( string value ) : bool
loadGene ( string name, string RBSf ) : bool
loadPromoterFormula ( string formula ) : bool
loadPromoterName ( string value ) : bool
loadPromoterOperon ( XmlNode node ) : bool
loadPromoterProductionMax ( string value ) : bool
loadPromoterTerminatorFactor ( string value ) : bool

Method Details

PartialEquals() protected méthode

protected PartialEquals ( IReaction, reaction ) : bool
reaction	IReaction,
Résultat	bool

PromoterReaction() public méthode

public PromoterReaction ( ) : System.Collections.Generic
Résultat	System.Collections.Generic

PromoterReaction() public méthode

public PromoterReaction ( PromoterReaction, r ) : System.Collections.Generic
r	PromoterReaction,
Résultat	System.Collections.Generic

ToString() public méthode

public ToString ( ) : string
Résultat	string

buildPromoterFromProps() public static méthode

public static buildPromoterFromProps ( PromoterProperties, props ) : IReaction,
props	PromoterProperties,
Résultat	IReaction,

getBeta() public méthode

public getBeta ( ) : float
Résultat	float

getFormula() public méthode

public getFormula ( ) : TreeNode
Résultat	TreeNode

getTerminatorFactor() public méthode

public getTerminatorFactor ( ) : float
Résultat	float

hasValidData() public méthode

public hasValidData ( ) : bool
Résultat	bool

hillFunc() public static méthode

public static hillFunc ( float K, float concentration, double n ) : float
K	float
concentration	float
n	double
Résultat	float

react() public méthode

public react ( ArrayList molecules ) : void
molecules	ArrayList
Résultat	void

setBeta() public méthode

public setBeta ( float beta ) : void
beta	float
Résultat	void

setFormula() public méthode

public setFormula ( TreeNode tree ) : void
tree	TreeNode
Résultat	void

setTerminatorFactor() public méthode

public setTerminatorFactor ( float v ) : void
v	float
Résultat	void

stepFunc() public static méthode

public static stepFunc ( float K, float concentration ) : float
K	float
concentration	float
Résultat	float

tryInstantiateFromXml() public méthode

public tryInstantiateFromXml ( XmlNode node ) : bool
node	XmlNode
Résultat	bool

Property Details

_beta protected_oe property

protected float _beta
Résultat	float