C# Class libsbml.Model

Inheritance: SBase

Afficher le fichier Open project: sys-bio/libroadrunner-deps Class Usage Examples

Méthodes publiques

Méthode	Description
Dispose ( ) : void
Model ( Model orig ) : System
Model ( SBMLNamespaces sbmlns ) : System
Model ( long level, long version ) : System
addCompartment ( Compartment c ) : int
addCompartmentType ( CompartmentType ct ) : int
addConstantAttribute ( ) : void
addConstraint ( Constraint c ) : int
addDefinitionsForDefaultUnits ( ) : void
addEvent ( Event e ) : int
addFunctionDefinition ( FunctionDefinition fd ) : int
addInitialAssignment ( InitialAssignment ia ) : int
addModifiers ( ) : void
addParameter ( Parameter p ) : int
addReaction ( Reaction r ) : int
addRule ( libsbml.Rule r ) : int
addSpecies ( Species s ) : int
addSpeciesType ( SpeciesType st ) : int
addUnitDefinition ( UnitDefinition ud ) : int
appendAnnotation ( XMLNode annotation ) : int
appendAnnotation ( string annotation ) : int
appendFrom ( Model model ) : int
assignRequiredValues ( ) : void
clone ( ) : Model
connectToChild ( ) : void
convertL1ToL2 ( ) : void
convertL1ToL3 ( ) : void
convertL1ToL3 ( bool addDefaultUnits ) : void
convertL2ToL1 ( ) : void
convertL2ToL1 ( bool strict ) : void
convertL2ToL3 ( ) : void
convertL2ToL3 ( bool strict ) : void
convertL2ToL3 ( bool strict, bool addDefaultUnits ) : void
convertL3ToL1 ( ) : void
convertL3ToL1 ( bool strict ) : void
convertL3ToL2 ( ) : void
convertL3ToL2 ( bool strict ) : void
convertParametersToLocals ( long level, long version ) : void
convertStoichiometryMath ( ) : void
createAlgebraicRule ( ) : AlgebraicRule
createAssignmentRule ( ) : AssignmentRule
createCompartment ( ) : Compartment
createCompartmentType ( ) : CompartmentType
createConstraint ( ) : Constraint
createDelay ( ) : Delay
createEvent ( ) : Event
createEventAssignment ( ) : EventAssignment
createFunctionDefinition ( ) : FunctionDefinition
createInitialAssignment ( ) : InitialAssignment
createKineticLaw ( ) : KineticLaw
createKineticLawLocalParameter ( ) : LocalParameter
createKineticLawParameter ( ) : Parameter
createModifier ( ) : ModifierSpeciesReference
createParameter ( ) : Parameter
createProduct ( ) : SpeciesReference
createRateRule ( ) : RateRule
createReactant ( ) : SpeciesReference
createReaction ( ) : Reaction
createSpecies ( ) : Species
createSpeciesType ( ) : SpeciesType
createTrigger ( ) : Trigger
createUnit ( ) : Unit
createUnitDefinition ( ) : UnitDefinition
dealWithDefaultValues ( ) : void
dealWithEvents ( bool strict ) : void
dealWithModelUnits ( ) : void
dealWithModelUnits ( bool strict ) : void
dealWithStoichiometry ( ) : void
enablePackageInternal ( string pkgURI, string pkgPrefix, bool flag ) : void
getAreaUnits ( ) : string
getAssignmentRule ( string variable ) : AssignmentRule
getAssignmentRuleByVariable ( string variable ) : AssignmentRule
getCompartment ( long n ) : Compartment
getCompartment ( string sid ) : Compartment
getCompartmentType ( long n ) : CompartmentType
getCompartmentType ( string sid ) : CompartmentType
getConstraint ( long n ) : Constraint
getConversionFactor ( ) : string
getElementByMetaId ( string metaid ) : SBase
getElementBySId ( string id ) : SBase
getElementName ( ) : string
getEvent ( long n ) : Event
getEvent ( string sid ) : Event
getExtentUnits ( ) : string
getFormulaUnitsDataForAssignment ( string sid ) : SWIGTYPE_p_FormulaUnitsData
getFormulaUnitsDataForVariable ( string sid ) : SWIGTYPE_p_FormulaUnitsData
getFunctionDefinition ( long n ) : FunctionDefinition
getFunctionDefinition ( string sid ) : FunctionDefinition
getId ( ) : string
getInitialAssignment ( long n ) : InitialAssignment
getInitialAssignment ( string symbol ) : InitialAssignment
getInitialAssignmentBySymbol ( string symbol ) : InitialAssignment
getLengthUnits ( ) : string
getListOfCompartmentTypes ( ) : ListOfCompartmentTypes
getListOfCompartments ( ) : ListOfCompartments
getListOfConstraints ( ) : ListOfConstraints
getListOfEvents ( ) : ListOfEvents
getListOfFunctionDefinitions ( ) : ListOfFunctionDefinitions
getListOfInitialAssignments ( ) : ListOfInitialAssignments
getListOfParameters ( ) : ListOfParameters
getListOfReactions ( ) : ListOfReactions
getListOfRules ( ) : ListOfRules
getListOfSpecies ( ) : ListOfSpecies
getListOfSpeciesTypes ( ) : ListOfSpeciesTypes
getListOfUnitDefinitions ( ) : ListOfUnitDefinitions
getModifierSpeciesReference ( string sid ) : ModifierSpeciesReference
getName ( ) : string
getNumCompartmentTypes ( ) : long
getNumCompartments ( ) : long
getNumConstraints ( ) : long
getNumEvents ( ) : long
getNumFunctionDefinitions ( ) : long
getNumInitialAssignments ( ) : long
getNumParameters ( ) : long
getNumReactions ( ) : long
getNumRules ( ) : long
getNumSpecies ( ) : long
getNumSpeciesTypes ( ) : long
getNumSpeciesWithBoundaryCondition ( ) : long
getNumUnitDefinitions ( ) : long
getParameter ( long n ) : Parameter
getParameter ( string sid ) : Parameter
getRateRule ( string variable ) : RateRule
getRateRuleByVariable ( string variable ) : RateRule
getReaction ( long n ) : Reaction
getReaction ( string sid ) : Reaction
getRule ( long n ) : Rule
getRule ( string variable ) : Rule
getRuleByVariable ( string variable ) : Rule
getSpecies ( long n ) : Species
getSpecies ( string sid ) : Species
getSpeciesReference ( string sid ) : SpeciesReference
getSpeciesType ( long n ) : SpeciesType
getSpeciesType ( string sid ) : SpeciesType
getSubstanceUnits ( ) : string
getTimeUnits ( ) : string
getTypeCode ( ) : int
getUnitDefinition ( long n ) : UnitDefinition
getUnitDefinition ( string sid ) : UnitDefinition
getVolumeUnits ( ) : string
hasRequiredElements ( ) : bool
isPopulatedListFormulaUnitsData ( ) : bool
isSetAreaUnits ( ) : bool
isSetConversionFactor ( ) : bool
isSetExtentUnits ( ) : bool
isSetId ( ) : bool
isSetLengthUnits ( ) : bool
isSetName ( ) : bool
isSetSubstanceUnits ( ) : bool
isSetTimeUnits ( ) : bool
isSetVolumeUnits ( ) : bool
populateListFormulaUnitsData ( ) : void
removeCompartment ( long n ) : Compartment
removeCompartment ( string sid ) : Compartment
removeCompartmentType ( long n ) : CompartmentType
removeCompartmentType ( string sid ) : CompartmentType
removeCompartmentTypes ( ) : void
removeConstraint ( long n ) : Constraint
removeEvent ( long n ) : Event
removeEvent ( string sid ) : Event
removeFromParentAndDelete ( ) : int
removeFunctionDefinition ( long n ) : FunctionDefinition
removeFunctionDefinition ( string sid ) : FunctionDefinition
removeInitialAssignment ( long n ) : InitialAssignment
removeInitialAssignment ( string symbol ) : InitialAssignment
removeParameter ( long n ) : Parameter
removeParameter ( string sid ) : Parameter
removeParameterRuleUnits ( bool strict ) : void
removeReaction ( long n ) : Reaction
removeReaction ( string sid ) : Reaction
removeRule ( long n ) : Rule
removeRule ( string variable ) : Rule
removeRuleByVariable ( string variable ) : Rule
removeSpecies ( long n ) : Species
removeSpecies ( string sid ) : Species
removeSpeciesType ( long n ) : SpeciesType
removeSpeciesType ( string sid ) : SpeciesType
removeSpeciesTypes ( ) : void
removeUnitDefinition ( long n ) : UnitDefinition
removeUnitDefinition ( string sid ) : UnitDefinition
renameAllIds ( IdentifierTransformer idTransformer ) : int
renameAllIds ( IdentifierTransformer idTransformer, ElementFilter filter ) : int
renameIDs ( SBaseList elements, IdentifierTransformer idTransformer ) : void
renameSIdRefs ( string oldid, string newid ) : void
renameUnitSIdRefs ( string oldid, string newid ) : void
setAnnotation ( XMLNode annotation ) : int
setAnnotation ( string annotation ) : int
setAreaUnits ( string units ) : int
setConversionFactor ( string units ) : int
setExtentUnits ( string units ) : int
setId ( string sid ) : int
setLengthUnits ( string units ) : int
setName ( string name ) : int
setSpatialDimensions ( ) : void
setSpatialDimensions ( double dims ) : void
setSpeciesReferenceConstantValueAndStoichiometry ( ) : void
setSubstanceUnits ( string units ) : int
setTimeUnits ( string units ) : int
setVolumeUnits ( string units ) : int
unsetAreaUnits ( ) : int
unsetConversionFactor ( ) : int
unsetExtentUnits ( ) : int
unsetId ( ) : int
unsetLengthUnits ( ) : int
unsetName ( ) : int
unsetSubstanceUnits ( ) : int
unsetTimeUnits ( ) : int
unsetVolumeUnits ( ) : int

Private Methods

Méthode	Description
Model ( IntPtr cPtr, bool cMemoryOwn ) : System
getCPtr ( Model obj ) : HandleRef
getCPtrAndDisown ( Model obj ) : HandleRef

Method Details

Dispose() public méthode

public Dispose ( ) : void
Résultat	void

Model() public méthode

public Model ( Model orig ) : System
orig	Model
Résultat	System

Model() public méthode

public Model ( SBMLNamespaces sbmlns ) : System
sbmlns	SBMLNamespaces
Résultat	System

Model() public méthode

public Model ( long level, long version ) : System
level	long
version	long
Résultat	System

addCompartment() public méthode

public addCompartment ( Compartment c ) : int
c	Compartment
Résultat	int

addCompartmentType() public méthode

public addCompartmentType ( CompartmentType ct ) : int
ct	CompartmentType
Résultat	int

addConstantAttribute() public méthode

public addConstantAttribute ( ) : void
Résultat	void

addConstraint() public méthode

public addConstraint ( Constraint c ) : int
c	Constraint
Résultat	int

addDefinitionsForDefaultUnits() public méthode

public addDefinitionsForDefaultUnits ( ) : void
Résultat	void

addEvent() public méthode

public addEvent ( Event e ) : int
e	Event
Résultat	int

addFunctionDefinition() public méthode

public addFunctionDefinition ( FunctionDefinition fd ) : int
fd	FunctionDefinition
Résultat	int

addInitialAssignment() public méthode

public addInitialAssignment ( InitialAssignment ia ) : int
ia	InitialAssignment
Résultat	int

addModifiers() public méthode

public addModifiers ( ) : void
Résultat	void

addParameter() public méthode

public addParameter ( Parameter p ) : int
p	Parameter
Résultat	int

addReaction() public méthode

public addReaction ( Reaction r ) : int
r	Reaction
Résultat	int

addRule() public méthode

public addRule ( libsbml.Rule r ) : int
r	libsbml.Rule
Résultat	int

addSpecies() public méthode

public addSpecies ( Species s ) : int
s	Species
Résultat	int

addSpeciesType() public méthode

public addSpeciesType ( SpeciesType st ) : int
st	SpeciesType
Résultat	int

addUnitDefinition() public méthode

public addUnitDefinition ( UnitDefinition ud ) : int
ud	UnitDefinition
Résultat	int

appendAnnotation() public méthode

public appendAnnotation ( XMLNode annotation ) : int
annotation	XMLNode
Résultat	int

appendAnnotation() public méthode

public appendAnnotation ( string annotation ) : int
annotation	string
Résultat	int

appendFrom() public méthode

public appendFrom ( Model model ) : int
model	Model
Résultat	int

assignRequiredValues() public méthode

public assignRequiredValues ( ) : void
Résultat	void

clone() public méthode

public clone ( ) : Model
Résultat	Model

connectToChild() public méthode

public connectToChild ( ) : void
Résultat	void

convertL1ToL2() public méthode

public convertL1ToL2 ( ) : void
Résultat	void

convertL1ToL3() public méthode

public convertL1ToL3 ( ) : void
Résultat	void

convertL1ToL3() public méthode

public convertL1ToL3 ( bool addDefaultUnits ) : void
addDefaultUnits	bool
Résultat	void

convertL2ToL1() public méthode

public convertL2ToL1 ( ) : void
Résultat	void

convertL2ToL1() public méthode

public convertL2ToL1 ( bool strict ) : void
strict	bool
Résultat	void

convertL2ToL3() public méthode

public convertL2ToL3 ( ) : void
Résultat	void

convertL2ToL3() public méthode

public convertL2ToL3 ( bool strict ) : void
strict	bool
Résultat	void

convertL2ToL3() public méthode

public convertL2ToL3 ( bool strict, bool addDefaultUnits ) : void
strict	bool
addDefaultUnits	bool
Résultat	void

convertL3ToL1() public méthode

public convertL3ToL1 ( ) : void
Résultat	void

convertL3ToL1() public méthode

public convertL3ToL1 ( bool strict ) : void
strict	bool
Résultat	void

convertL3ToL2() public méthode

public convertL3ToL2 ( ) : void
Résultat	void

convertL3ToL2() public méthode

public convertL3ToL2 ( bool strict ) : void
strict	bool
Résultat	void

convertParametersToLocals() public méthode

public convertParametersToLocals ( long level, long version ) : void
level	long
version	long
Résultat	void

convertStoichiometryMath() public méthode

public convertStoichiometryMath ( ) : void
Résultat	void

createAlgebraicRule() public méthode

public createAlgebraicRule ( ) : AlgebraicRule
Résultat	AlgebraicRule

createAssignmentRule() public méthode

public createAssignmentRule ( ) : AssignmentRule
Résultat	AssignmentRule

createCompartment() public méthode

public createCompartment ( ) : Compartment
Résultat	Compartment

createCompartmentType() public méthode

public createCompartmentType ( ) : CompartmentType
Résultat	CompartmentType

createConstraint() public méthode

public createConstraint ( ) : Constraint
Résultat	Constraint

createDelay() public méthode

public createDelay ( ) : Delay
Résultat	Delay

createEvent() public méthode

public createEvent ( ) : Event
Résultat	Event

createEventAssignment() public méthode

public createEventAssignment ( ) : EventAssignment
Résultat	EventAssignment

createFunctionDefinition() public méthode

public createFunctionDefinition ( ) : FunctionDefinition
Résultat	FunctionDefinition

createInitialAssignment() public méthode

public createInitialAssignment ( ) : InitialAssignment
Résultat	InitialAssignment

createKineticLaw() public méthode

public createKineticLaw ( ) : KineticLaw
Résultat	KineticLaw

createKineticLawLocalParameter() public méthode

public createKineticLawLocalParameter ( ) : LocalParameter
Résultat	LocalParameter

createKineticLawParameter() public méthode

public createKineticLawParameter ( ) : Parameter
Résultat	Parameter

createModifier() public méthode

public createModifier ( ) : ModifierSpeciesReference
Résultat	ModifierSpeciesReference

createParameter() public méthode

public createParameter ( ) : Parameter
Résultat	Parameter

createProduct() public méthode

public createProduct ( ) : SpeciesReference
Résultat	SpeciesReference

createRateRule() public méthode

public createRateRule ( ) : RateRule
Résultat	RateRule

createReactant() public méthode

public createReactant ( ) : SpeciesReference
Résultat	SpeciesReference

createReaction() public méthode

public createReaction ( ) : Reaction
Résultat	Reaction

createSpecies() public méthode

public createSpecies ( ) : Species
Résultat	Species

createSpeciesType() public méthode

public createSpeciesType ( ) : SpeciesType
Résultat	SpeciesType

createTrigger() public méthode

public createTrigger ( ) : Trigger
Résultat	Trigger

createUnit() public méthode

public createUnit ( ) : Unit
Résultat	Unit

createUnitDefinition() public méthode

public createUnitDefinition ( ) : UnitDefinition
Résultat	UnitDefinition

dealWithDefaultValues() public méthode

public dealWithDefaultValues ( ) : void
Résultat	void

dealWithEvents() public méthode

public dealWithEvents ( bool strict ) : void
strict	bool
Résultat	void

dealWithModelUnits() public méthode

public dealWithModelUnits ( ) : void
Résultat	void

dealWithModelUnits() public méthode

public dealWithModelUnits ( bool strict ) : void
strict	bool
Résultat	void

dealWithStoichiometry() public méthode

public dealWithStoichiometry ( ) : void
Résultat	void

enablePackageInternal() public méthode

public enablePackageInternal ( string pkgURI, string pkgPrefix, bool flag ) : void
pkgURI	string
pkgPrefix	string
flag	bool
Résultat	void

getAreaUnits() public méthode

public getAreaUnits ( ) : string
Résultat	string

getAssignmentRule() public méthode

public getAssignmentRule ( string variable ) : AssignmentRule
variable	string
Résultat	AssignmentRule

getAssignmentRuleByVariable() public méthode

public getAssignmentRuleByVariable ( string variable ) : AssignmentRule
variable	string
Résultat	AssignmentRule

getCompartment() public méthode

public getCompartment ( long n ) : Compartment
n	long
Résultat	Compartment

getCompartment() public méthode

public getCompartment ( string sid ) : Compartment
sid	string
Résultat	Compartment

getCompartmentType() public méthode

public getCompartmentType ( long n ) : CompartmentType
n	long
Résultat	CompartmentType

getCompartmentType() public méthode

public getCompartmentType ( string sid ) : CompartmentType
sid	string
Résultat	CompartmentType

getConstraint() public méthode

public getConstraint ( long n ) : Constraint
n	long
Résultat	Constraint

getConversionFactor() public méthode

public getConversionFactor ( ) : string
Résultat	string

getElementByMetaId() public méthode

public getElementByMetaId ( string metaid ) : SBase
metaid	string
Résultat	SBase

getElementBySId() public méthode

public getElementBySId ( string id ) : SBase
id	string
Résultat	SBase

getElementName() public méthode

public getElementName ( ) : string
Résultat	string

getEvent() public méthode

public getEvent ( long n ) : Event
n	long
Résultat	Event

getEvent() public méthode

public getEvent ( string sid ) : Event
sid	string
Résultat	Event

getExtentUnits() public méthode

public getExtentUnits ( ) : string
Résultat	string

getFormulaUnitsDataForAssignment() public méthode

public getFormulaUnitsDataForAssignment ( string sid ) : SWIGTYPE_p_FormulaUnitsData
sid	string
Résultat	SWIGTYPE_p_FormulaUnitsData

getFormulaUnitsDataForVariable() public méthode

public getFormulaUnitsDataForVariable ( string sid ) : SWIGTYPE_p_FormulaUnitsData
sid	string
Résultat	SWIGTYPE_p_FormulaUnitsData

getFunctionDefinition() public méthode

public getFunctionDefinition ( long n ) : FunctionDefinition
n	long
Résultat	FunctionDefinition

getFunctionDefinition() public méthode

public getFunctionDefinition ( string sid ) : FunctionDefinition
sid	string
Résultat	FunctionDefinition

getId() public méthode

public getId ( ) : string
Résultat	string

getInitialAssignment() public méthode

public getInitialAssignment ( long n ) : InitialAssignment
n	long
Résultat	InitialAssignment

getInitialAssignment() public méthode

public getInitialAssignment ( string symbol ) : InitialAssignment
symbol	string
Résultat	InitialAssignment

getInitialAssignmentBySymbol() public méthode

public getInitialAssignmentBySymbol ( string symbol ) : InitialAssignment
symbol	string
Résultat	InitialAssignment

getLengthUnits() public méthode

public getLengthUnits ( ) : string
Résultat	string

getListOfCompartmentTypes() public méthode

public getListOfCompartmentTypes ( ) : ListOfCompartmentTypes
Résultat	ListOfCompartmentTypes

getListOfCompartments() public méthode

public getListOfCompartments ( ) : ListOfCompartments
Résultat	ListOfCompartments

getListOfConstraints() public méthode

public getListOfConstraints ( ) : ListOfConstraints
Résultat	ListOfConstraints

getListOfEvents() public méthode

public getListOfEvents ( ) : ListOfEvents
Résultat	ListOfEvents

getListOfFunctionDefinitions() public méthode

public getListOfFunctionDefinitions ( ) : ListOfFunctionDefinitions
Résultat	ListOfFunctionDefinitions

getListOfInitialAssignments() public méthode

public getListOfInitialAssignments ( ) : ListOfInitialAssignments
Résultat	ListOfInitialAssignments

getListOfParameters() public méthode

public getListOfParameters ( ) : ListOfParameters
Résultat	ListOfParameters

getListOfReactions() public méthode

public getListOfReactions ( ) : ListOfReactions
Résultat	ListOfReactions

getListOfRules() public méthode

public getListOfRules ( ) : ListOfRules
Résultat	ListOfRules

getListOfSpecies() public méthode

public getListOfSpecies ( ) : ListOfSpecies
Résultat	ListOfSpecies

getListOfSpeciesTypes() public méthode

public getListOfSpeciesTypes ( ) : ListOfSpeciesTypes
Résultat	ListOfSpeciesTypes

getListOfUnitDefinitions() public méthode

public getListOfUnitDefinitions ( ) : ListOfUnitDefinitions
Résultat	ListOfUnitDefinitions

getModifierSpeciesReference() public méthode

public getModifierSpeciesReference ( string sid ) : ModifierSpeciesReference
sid	string
Résultat	ModifierSpeciesReference

getName() public méthode

public getName ( ) : string
Résultat	string

getNumCompartmentTypes() public méthode

public getNumCompartmentTypes ( ) : long
Résultat	long

getNumCompartments() public méthode

public getNumCompartments ( ) : long
Résultat	long

getNumConstraints() public méthode

public getNumConstraints ( ) : long
Résultat	long

getNumEvents() public méthode

public getNumEvents ( ) : long
Résultat	long

getNumFunctionDefinitions() public méthode

public getNumFunctionDefinitions ( ) : long
Résultat	long

getNumInitialAssignments() public méthode

public getNumInitialAssignments ( ) : long
Résultat	long

getNumParameters() public méthode

public getNumParameters ( ) : long
Résultat	long

getNumReactions() public méthode

public getNumReactions ( ) : long
Résultat	long

getNumRules() public méthode

public getNumRules ( ) : long
Résultat	long

getNumSpecies() public méthode

public getNumSpecies ( ) : long
Résultat	long

getNumSpeciesTypes() public méthode

public getNumSpeciesTypes ( ) : long
Résultat	long

getNumSpeciesWithBoundaryCondition() public méthode

public getNumSpeciesWithBoundaryCondition ( ) : long
Résultat	long

getNumUnitDefinitions() public méthode

public getNumUnitDefinitions ( ) : long
Résultat	long

getParameter() public méthode

public getParameter ( long n ) : Parameter
n	long
Résultat	Parameter

getParameter() public méthode

public getParameter ( string sid ) : Parameter
sid	string
Résultat	Parameter

getRateRule() public méthode

public getRateRule ( string variable ) : RateRule
variable	string
Résultat	RateRule

getRateRuleByVariable() public méthode

public getRateRuleByVariable ( string variable ) : RateRule
variable	string
Résultat	RateRule

getReaction() public méthode

public getReaction ( long n ) : Reaction
n	long
Résultat	Reaction

getReaction() public méthode

public getReaction ( string sid ) : Reaction
sid	string
Résultat	Reaction

getRule() public méthode

public getRule ( long n ) : Rule
n	long
Résultat	Rule

getRule() public méthode

public getRule ( string variable ) : Rule
variable	string
Résultat	Rule

getRuleByVariable() public méthode

public getRuleByVariable ( string variable ) : Rule
variable	string
Résultat	Rule

getSpecies() public méthode

public getSpecies ( long n ) : Species
n	long
Résultat	Species

getSpecies() public méthode

public getSpecies ( string sid ) : Species
sid	string
Résultat	Species

getSpeciesReference() public méthode

public getSpeciesReference ( string sid ) : SpeciesReference
sid	string
Résultat	SpeciesReference

getSpeciesType() public méthode

public getSpeciesType ( long n ) : SpeciesType
n	long
Résultat	SpeciesType

getSpeciesType() public méthode

public getSpeciesType ( string sid ) : SpeciesType
sid	string
Résultat	SpeciesType

getSubstanceUnits() public méthode

public getSubstanceUnits ( ) : string
Résultat	string

getTimeUnits() public méthode

public getTimeUnits ( ) : string
Résultat	string

getTypeCode() public méthode

public getTypeCode ( ) : int
Résultat	int

getUnitDefinition() public méthode

public getUnitDefinition ( long n ) : UnitDefinition
n	long
Résultat	UnitDefinition

getUnitDefinition() public méthode

public getUnitDefinition ( string sid ) : UnitDefinition
sid	string
Résultat	UnitDefinition

getVolumeUnits() public méthode

public getVolumeUnits ( ) : string
Résultat	string

hasRequiredElements() public méthode

public hasRequiredElements ( ) : bool
Résultat	bool

isPopulatedListFormulaUnitsData() public méthode

public isPopulatedListFormulaUnitsData ( ) : bool
Résultat	bool

isSetAreaUnits() public méthode

public isSetAreaUnits ( ) : bool
Résultat	bool

isSetConversionFactor() public méthode

public isSetConversionFactor ( ) : bool
Résultat	bool

isSetExtentUnits() public méthode

public isSetExtentUnits ( ) : bool
Résultat	bool

isSetId() public méthode

public isSetId ( ) : bool
Résultat	bool

isSetLengthUnits() public méthode

public isSetLengthUnits ( ) : bool
Résultat	bool

isSetName() public méthode

public isSetName ( ) : bool
Résultat	bool

isSetSubstanceUnits() public méthode

public isSetSubstanceUnits ( ) : bool
Résultat	bool

isSetTimeUnits() public méthode

public isSetTimeUnits ( ) : bool
Résultat	bool

isSetVolumeUnits() public méthode

public isSetVolumeUnits ( ) : bool
Résultat	bool

populateListFormulaUnitsData() public méthode

public populateListFormulaUnitsData ( ) : void
Résultat	void

removeCompartment() public méthode

public removeCompartment ( long n ) : Compartment
n	long
Résultat	Compartment

removeCompartment() public méthode

public removeCompartment ( string sid ) : Compartment
sid	string
Résultat	Compartment

removeCompartmentType() public méthode

public removeCompartmentType ( long n ) : CompartmentType
n	long
Résultat	CompartmentType

removeCompartmentType() public méthode

public removeCompartmentType ( string sid ) : CompartmentType
sid	string
Résultat	CompartmentType

removeCompartmentTypes() public méthode

public removeCompartmentTypes ( ) : void
Résultat	void

removeConstraint() public méthode

public removeConstraint ( long n ) : Constraint
n	long
Résultat	Constraint

removeEvent() public méthode

public removeEvent ( long n ) : Event
n	long
Résultat	Event

removeEvent() public méthode

public removeEvent ( string sid ) : Event
sid	string
Résultat	Event

removeFromParentAndDelete() public méthode

public removeFromParentAndDelete ( ) : int
Résultat	int

removeFunctionDefinition() public méthode

public removeFunctionDefinition ( long n ) : FunctionDefinition
n	long
Résultat	FunctionDefinition

removeFunctionDefinition() public méthode

public removeFunctionDefinition ( string sid ) : FunctionDefinition
sid	string
Résultat	FunctionDefinition

removeInitialAssignment() public méthode

public removeInitialAssignment ( long n ) : InitialAssignment
n	long
Résultat	InitialAssignment

removeInitialAssignment() public méthode

public removeInitialAssignment ( string symbol ) : InitialAssignment
symbol	string
Résultat	InitialAssignment

removeParameter() public méthode

public removeParameter ( long n ) : Parameter
n	long
Résultat	Parameter

removeParameter() public méthode

public removeParameter ( string sid ) : Parameter
sid	string
Résultat	Parameter

removeParameterRuleUnits() public méthode

public removeParameterRuleUnits ( bool strict ) : void
strict	bool
Résultat	void

removeReaction() public méthode

public removeReaction ( long n ) : Reaction
n	long
Résultat	Reaction

removeReaction() public méthode

public removeReaction ( string sid ) : Reaction
sid	string
Résultat	Reaction

removeRule() public méthode

public removeRule ( long n ) : Rule
n	long
Résultat	Rule

removeRule() public méthode

public removeRule ( string variable ) : Rule
variable	string
Résultat	Rule

removeRuleByVariable() public méthode

public removeRuleByVariable ( string variable ) : Rule
variable	string
Résultat	Rule

removeSpecies() public méthode

public removeSpecies ( long n ) : Species
n	long
Résultat	Species

removeSpecies() public méthode

public removeSpecies ( string sid ) : Species
sid	string
Résultat	Species

removeSpeciesType() public méthode

public removeSpeciesType ( long n ) : SpeciesType
n	long
Résultat	SpeciesType

removeSpeciesType() public méthode

public removeSpeciesType ( string sid ) : SpeciesType
sid	string
Résultat	SpeciesType

removeSpeciesTypes() public méthode

public removeSpeciesTypes ( ) : void
Résultat	void

removeUnitDefinition() public méthode

public removeUnitDefinition ( long n ) : UnitDefinition
n	long
Résultat	UnitDefinition

removeUnitDefinition() public méthode

public removeUnitDefinition ( string sid ) : UnitDefinition
sid	string
Résultat	UnitDefinition

renameAllIds() public méthode

public renameAllIds ( IdentifierTransformer idTransformer ) : int
idTransformer	IdentifierTransformer
Résultat	int

renameAllIds() public méthode

public renameAllIds ( IdentifierTransformer idTransformer, ElementFilter filter ) : int
idTransformer	IdentifierTransformer
filter	ElementFilter
Résultat	int

renameIDs() public méthode

public renameIDs ( SBaseList elements, IdentifierTransformer idTransformer ) : void
elements	SBaseList
idTransformer	IdentifierTransformer
Résultat	void

renameSIdRefs() public méthode

public renameSIdRefs ( string oldid, string newid ) : void
oldid	string
newid	string
Résultat	void

renameUnitSIdRefs() public méthode

public renameUnitSIdRefs ( string oldid, string newid ) : void
oldid	string
newid	string
Résultat	void

setAnnotation() public méthode

public setAnnotation ( XMLNode annotation ) : int
annotation	XMLNode
Résultat	int

setAnnotation() public méthode

public setAnnotation ( string annotation ) : int
annotation	string
Résultat	int

setAreaUnits() public méthode

public setAreaUnits ( string units ) : int
units	string
Résultat	int

setConversionFactor() public méthode

public setConversionFactor ( string units ) : int
units	string
Résultat	int

setExtentUnits() public méthode

public setExtentUnits ( string units ) : int
units	string
Résultat	int

setId() public méthode

public setId ( string sid ) : int
sid	string
Résultat	int

setLengthUnits() public méthode

public setLengthUnits ( string units ) : int
units	string
Résultat	int

setName() public méthode

public setName ( string name ) : int
name	string
Résultat	int

setSpatialDimensions() public méthode

public setSpatialDimensions ( ) : void
Résultat	void

setSpatialDimensions() public méthode

public setSpatialDimensions ( double dims ) : void
dims	double
Résultat	void

setSpeciesReferenceConstantValueAndStoichiometry() public méthode

public setSpeciesReferenceConstantValueAndStoichiometry ( ) : void
Résultat	void

setSubstanceUnits() public méthode

public setSubstanceUnits ( string units ) : int
units	string
Résultat	int

setTimeUnits() public méthode

public setTimeUnits ( string units ) : int
units	string
Résultat	int

setVolumeUnits() public méthode

public setVolumeUnits ( string units ) : int
units	string
Résultat	int

unsetAreaUnits() public méthode

public unsetAreaUnits ( ) : int
Résultat	int

unsetConversionFactor() public méthode

public unsetConversionFactor ( ) : int
Résultat	int

unsetExtentUnits() public méthode

public unsetExtentUnits ( ) : int
Résultat	int

unsetId() public méthode

public unsetId ( ) : int
Résultat	int

unsetLengthUnits() public méthode

public unsetLengthUnits ( ) : int
Résultat	int

unsetName() public méthode

public unsetName ( ) : int
Résultat	int

unsetSubstanceUnits() public méthode

public unsetSubstanceUnits ( ) : int
Résultat	int

unsetTimeUnits() public méthode

public unsetTimeUnits ( ) : int
Résultat	int

unsetVolumeUnits() public méthode

public unsetVolumeUnits ( ) : int
Résultat	int